Poco antes del comienzo del encierro, los mozos que correrán en el tramo de Santo Domingo, se encomiendan a la imagen del patrón colocada en una hornacina y adornada con los pañuelos de las peñas. El cántico a San Fermín se repite por tres veces, solicitando al santo su protección durante la carrera delante de los toros.
La letra del cántico tradicional previo al encierro dice:
A San Fermín pedimos,
por ser nuestro patrón,
nos guíe en el encierro
dándonos su bendición.
por ser nuestro patrón,
nos guíe en el encierro
dándonos su bendición.
Las tres repeticiones finalizan con el grito de:
¡Viva San Fermín!
¡Gora San Fermín!
¡Gora San Fermín!
Desde los sanfermines de 2009, se alterna en cada una de las tres ocasiones un cántico en castellano y un cántico en euskera. La letra del cántico a San Fermín en euskera reza así:
Entzun arreen San Fermin
zu zaitugu patroi
zuzendu gure oinak
entzierro hontan otoi
zu zaitugu patroi
zuzendu gure oinak
entzierro hontan otoi